Телетайп

• Геномы в облаке — Amazon.com объявил о размещении на своих серверах (Amazon’s Cloud) 200 Тб информации базы, полученных после анализа 1700 геномов. Причем — бесплатно. — Nat. biotech.
• Под действием бактерицидных антибиотиков бактерии убивают себя сами — Стал известен общий механизм, лежащий в основе бактерицидного действия большинства применяемых в настоящее время антибиотиков. Стимулируемое антибиотиками образование свободных радикалов приводит к накоплению критического количества поврежденных гуаниновых оснований в составе ДНК и РНК; попытка клетки исправить причиненный урон приводит к гибели. — Элементы, Science..
• Гены на дистанционном управлении — Исследоватили из Рокефеллерского Университета в Нью Йорке предложили и реализовали концепцию неинвазивной активации генов под действием низкочастотного радиоизлучения. Согласно довольно мудреной схеме, в подкожную опухоль крысы делали инъекцию наночастиц, покрытых оксидом железа и содержащих антитела к теплочувствительным ионным каналам TPRV1. Наночастицы адсорбировались на поверхности клеток и под воздействием внешнего низкочастотного радиоизлучения вызывали локальное повышени температуры до 42 °C, что способствует открытию каналов TRPV1 и повышению концентрации кальция внутри клетки. Это, в свою очередь, вызывало активации модифицированного кальций-зависимого гена продукции инсулина. В течении получаса в кровотоке подопытной крысы наблюдалось повышение уровня инсулина и снижение концентрации сахара. Несмотря на то, что данная схема на данный момент не имеет прямого практического применения, она иллюстрирует будущее прецензионной терапии, аналогично концепт-карам в автомобилестроении. Nature.
• Доказано древнее происхождение белых медведей — Недавние исследования митохондриальной ДНК разных видов медведей показали, что все ныне живущие белые медведи берут начало от одной популяции бурых медведей, существовавшей около 120 тысяч лет назад на Аляске. Эта датировка слишком молодая, чтобы принять ее без возражений. Новое исследование показывает ограничения примененного метода и дает новые оценки возраста становления белых медведей — около 600 тысяч лет. — Элементы, Science.
• Чей секвенатор лучше? — Британские ученые провели сравнительное исследование трех моделей современных секвенаторов на вирулентном штамме E. coli, ставшим причиной смерти более 40 человек в Германии прошлым летом. В соревновании участвовали 454 GS Junior (Roche), MiSeq (Illumina) и Ion Torrent Personal Genome Machine (PGM, Life Technologies). Как и ожидалось, ни одна компания не предлагает универсального решения на сегодня : PGM обладает наибольшей производительностью в час, MiSeq показал наибольшую производительность за запуск и наивысшую точность прочтения, Junior способен генерировать наиболее длинные фрагменты. При этом у PGM и MiSeq наблюдаются проблемы в точности прочтения длинных мононуклеотидны фрагментов. Данное исследование крайне востребованно потребителями, поскольку агрессивная рекламная политика производителей секвенаторов не позволяет рационально оценить достоинства и проблемы их аппаратов по сравнению с конкурентами. Nature.